Jmol — программа для просмотра структуры молекул в трёх измерениях.
Jmol используется как для учебных целей[2], так и при проведении научных исследований в области молекулярной биологии, химии и биохимии. Программа является свободной и открытой. Она написана на языке Java и потому является кроссплатформенной. Существует как отдельная программа, так и средства для интеграции в другое Java-приложение. Чаще всего программа используется как аплет, встраиваемый в веб-страницу. Программа позволяет строить изображения молекул несколькими способами. Jmol поддерживает большое количество форматов файлов, включая:
- Protein Data Bank (pdb)
- Crystallographic Information File (cif)
- MDL Molfile (mol)
- Chemical Markup Language (CML)
- Chemical File Format (XYZ).
Скриншоты
-
Кристаллическая структура H/ACA коробки RNP из архебактерии Pyrococcus furiosus. -
Подсвечивание двух солевых мостиков в тетрамере гемоглобина (гемо-группа изображена палочками в нижнем правом углу). -
Фрагмент транскрипционного фактора TFIIIA, образующего три последовательных цинковых пальца, присоединённых к последовательности ДНК. -
Ссылки
См. также
Примечания
- ↑ Willighagen E. Processing CML conventions in Java (англ.) // Internet Journal of Chemistry — 2001. — Vol. 4. — P. 4. — 9 p. — ISSN 1099-8292 — doi:10.5281/ZENODO.1495470
- ↑ A. Herraez. Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue (англ.) // Biochemistry and Molecular Biology Education. — 2006. — Vol. 34, no. 4. — P. 7. Архивировано 31 мая 2020 года.
You must be logged in to post a comment.