This is the list of châteaux, which are located in Franche-Comté.

• Château des Archevêques, in Etalans
• Château de Belvoir, in Belvoir
• Citadelle de Besançon, in Besançon
• Château de Bournel, in Cubry
• Château de Chalamont, in Villers-sous-Chalamont
• Château de Charencey, in Chenecey-Buillon
• Château de Château de Châteauvieux, in Châteauvieux-les-Fossés
• Château de Châtel Derrière and Château des ducs de Wurtemberg, in Montbéliard
• Château de Cléron, in Cléron
• Château de Corcondray, in Corcondray
• Château de Durnes, in Durnes
• Château de Fertans, in Fertans
• Château de Fourg, in Fourg
• Château de Franois, in Franois
• Château de Goux les Usiers, in Goux-les-Usiers
• Château de Joux, in Joux
• Château de Montby, in Gondenans-Montby
• Château du Désert, in Maîche
• Château de Mérode, in Maîche
• Château de Montalembert, in Maîche
• Château de l'Hermitage, in Mancenans-Lizerne
• Château de Montfaucon, in Montfaucon
• Château de Montferrand, in Montferrand-le-Château
• Château de Montjoie, in Montjoie-le-Château
• Château de Montrond, in Montrond-le-Château
• Château de d'Ornans, in Ornans
• Château de Puy de Montenot, in Arc-sous-Montenot
• Château de La Roche, in Rigney
• Château de Roche-sur-Loue, in Arc-et-Senans
• Château de Rochejean, in Rochejean
• Château de Roulans, in Roulans
• Château de Saint-Denis, in Chassagne-Saint-Denis
• Château de Sainte-Anne, in Sainte-Anne
• Château de Sombacour, in Sombacour
• Château de Thoraise, in Thoraise
• Château de Vaire-Le-Grand, in Vaire-Arcier
• Château de Vuillafans, in Vuillafans

• Château de Borey, in Borey
• Château d'Étobon, in Étobon
• Château de Filain, in Filain
• Château des Grammont, in Villersexel
• Château de Granges-le-Bourg, in Granges-le-Bourg
• Château de Héricourt, in Héricourt
• Château d'Oricourt, in Oricourt
• Château de Ray-sur-Saône, in Ray-sur-Saône
• Château de Vallerois-le-Bois, in Vallerois-le-Bois

• Château d'Andelot, in Andelot-Morval
• Château d'Arlay, in Arlay
• Château de Baume, in Saint-Lothain
• Château de Chevreaux, in Chevreaux
• Château de Cornod, in Cornod
• Château de Domblans, in Domblans
• Château de Dramelay, in Dramelay
• Château de Frontenay, in Frontenay
• Château Gréa, in Rotalier
• Château de Mérona, in Mérona
• Château de Mirebel, in Mirebel
• Château de Mutigney in Mutigney
• Château de la Muyre, in Domblans
• Château d'Oliferne, in Vescles
• Château d'Ougney, in Ougney
• Château de Présilly, in Présilly
• Château de Pymont, in Villeneuve-sous-Pymont
• Château de Syam, in Champagnole

• Château de Belfort, in Belfort
• Château du Rosemont, in Riervescemont
• Château de Rougemont, in Rougemont-le-Château

• List of castles in France