Mats Estonius (sündinud 3. juunil 1960 Rootsis) on eesti arstiteadlane.

1994. aastal kaitses ta Karolinska Instituudis doktoritöö meditsiinilises biokeemias ja biofüüsikas.^[1]

Aastatel 2006–2011 oli ta Tallinna Ülikoolis algul teadus- ja arendusprorektor, hiljem teadusprorektor.

• Eda Post. Mats Estonius – üks kaheksast Estoniusest, Eesti Päevaleht, 3. juuni 2006