Ensüümiklasside nomenklatuur ehk Ensüümide nomenklatuur ehk Ensüümide nimestik on Ensüümikomisjoni poolt koostatud ensüümide nomenklatuur.[1]
Funktsioonid
Ensüümiklasside nomenklatuuri koostamine ja ensüümide ning koensüümide klassifitseerimine, samuti ensüümide sümbolitega seonduv ning ensüümide aktiivsuse ja ensüümikineetika mõõtmise ja kirjeldamise metoodika koostamine.[2][3][4]
Süstemaatika
Ensüümikomisjoni raportite alusel jagatakse ensüümid, soovituslikult, katalüüsitavate reaktsioonide alusel kuude klassi.
Ensüümide klassid
Klassid on ensüümide nomenklatuuris ära toodud numbritega EC. 1 – EC. 6:[3][5] (EC tähistab ingliskeelseid sõnu Enzyme Commission)
Ensüümide klassid inimkeha biokeemiliste reaktsioonide kaudu
| Klassi number | Süstemaatiline nimetus | Mõningate alaklasside triviaalnimetused |
|---|---|---|
| EC 1. | Oksüdoreduktaasid | dehüdrogenaasid, oksügenaasid, oksüdaasid, katalaasid, peroksüdaasid, reduktaasid |
| EC 2. | Transferaasid | aminotransferaasid, atsüültransferaasid, glükosüültransferaasid, kinaasid |
| EC 3. | Hüdrolaasid | desaminaasid, esteraasid, fosfataasid, fosfolipaasid, peptidaasid, ribonukleaasid |
| EC 4. | Lüaasid | aldolaasid,dehüdrataasid, dekarboksülaasid, hüdrataasid, süntaasid |
| EC 5. | Isomeraasid | epimeraasid,isomeraasid, ratsemaasid |
| EC 6. | Ligaasid | karboksülaasid, süntetaasid |
Alaklassid
Klassid jagatakse ensüümide nomenklatuuris alaklassidesse, mida tähistatakse numbritega 1-99-ni, näit
- EC 3.4. näitab ära klassi alaklassi;
Ala-alaklassid
- EC 3.4.13. näitab ära ala-alaklassi dipeptidaasid, toime peptiidsidemete kaudu;
Üksikensüüm
Viimane number ensüümide neljanumbrilises koodis näitab ära üksikensüümi järjekorranumbri ala-alaklassi kuuluvuse alusel, näiteks üksikensüüm
- EC 3.4.13.4 Xaa-Arg-dipeptidaas
Üksikensüümide loetelu täieneb pidevalt.
Andmebaasid
Ensüümiklasside jaotus ning liikmed ja nende toime ja organismid ning geenid on ära toodud ka erinevates andmebaasides nagu NC-IUBMB, BRENDA[6], EXPASY[7], KEGG[8], Metacyc[9] jpt.[10]
Ajaloolist
- 1964. aastal anti välja esimene ensüümide soovituslik klassifikatsioon Recommendations (1964) of the International Union of Biochemistry on the Nomenclature and Classification of Enzymes.[4]
Viited
- ↑ http://mt.legaltext.ee/esterm/concept.asp?conceptID=41940&term=ens%FC%FCmide%20nomenklatuur Vaadatud 06.08.2013)
- ↑ http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/history.html
- ↑ 3,0 3,1 Mihkel Zilmer, Ello Karelson,Tiiu Vihalemm, Aune Rehema, Kersti Zilmer. Inimorganismi biomolekulid ja nende meditsiiniliselt olulisemad ülesanded Inimorganismi metabolism, selle häired ja haigused , lk 118, Biokeemia Instituut, Tartu Ülikool 2010, ISBN 978-9985-2-1540-1.
- ↑ 4,0 4,1 Enzyme nomenclature 1978
- ↑ Enzyme nomenclature, 1978. Recommendations (1978) of the Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry, Academic Press, 1979, ISBN 0-12-227160-2. Google`i raamatu osaline veebiversioon (vaadatud (23.05.2013)
- ↑ "Arhiivikoopia". Originaali arhiivikoopia seisuga 12. detsember 2012. Vaadatud 25. juulil 2013.
{{netiviide}}: CS1 hooldus: arhiivikoopia kasutusel pealkirjana (link) - ↑ http://enzyme.expasy.org/
- ↑ http://www.genome.jp/dbget/
- ↑ http://www.metacyc.org/cpd-search.shtml
- ↑ "Meditsiinisõnastik", 2004, Kirjastus Medicina, ISBN 9985-829-55-7
Välislingid
- NC-IUBMB. "Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology". Report from the introduction to Enzyme Nomenclature Historical Introduction, Veebiversioon (vaadatud 23.05.2013)
- Veebiversioon (vaadatud 23.05.2013) Ensüümide Nomenklatuur
