Mombasa (suahiili keeles ka Mvita) on linn Keenias, Mombasa maakonna halduskeskus.

Kuni märtsini 2013 oli Mombasa Rannikuprovintsi halduskeskus.

Linn asub India ookeani rannikul oleval Mombasa saarel. Mombasa on tähtis sadamalinn.

Linna asutasid 11. sajandil araabia kaupmehed.

Vasco da Gama külastas linna esimese eurooplasena 1498. aastal ja 1500. aastal portugallased vallutasid Mombasa. Nemad rajasid 16. sajandi lõpul ka Jeesuse fordi, mis tänapäeval on UNESCO maailmapärandis ning on oluline vaatamisväärsus ja turismisihtkoht Mombasas.