System Ninja — бесплатная программа, предназначенная для очистки нежелательного мусора на компьютере под управлением операционной системы Microsoft Windows.

Для запуска программы требуется предустановленный пакет .NET Framework 3.5 SP1 и выше.

Утилита является средством для очистки ненужных файлов в системе. Главное отличие утилиты от большинства подобных, к примеру, CCleaner, которые ищут мусор в конкретных указанных пользователем местах, механизм сканирования System Ninja обнаруживает системный мусор, где бы он ни находился, производя анализ по всей файловой системе. После выполнения операции в системе программа предоставляет полный отчёт со всеми деталями для того, чтобы пользователь мог собственноручно решить дальнейшую судьбу каждого файла.

System Ninja оснащена дополнительными утилитами, в числе которых есть Startup Manager, App Uninstaller, Process Manager, PC Analysis, а также инструментами —

• Windows Service Manager — позволяет останавливать и запускать системные службы.
• FileAnalyzr — анализатор файлов, умеет автоматически возвращать контрольные суммы (MD5, SHA1 и SHA-256), дату и время последнего доступа, дату создания и размер на диске и многое другое.
• Registry Cleaner — поиск и удаление ненужных ключей реестра.

• Сканирование и анализ по всей файловой системе.
• Графический интерфейс пользователя.
• Очиcтка истории системного реестра.
• Менеджер управления автозапуска программ.
• Наличие деинсталлятора программы.
• Менеджер процессов.
• Инструмент CCEnhancer, позволяющий взаимодействовать совместно с популярной утилитой для очистки системы CCleaner^[1][2].

System Ninja Portable — это специальная версия System Ninja, предназначенная для работы со сменных носителей информации, таких, как USB флэш-диск, Memory Stick, iPod/MP3 и прочих устройств.

• Официальная веб-страница System Ninja
• System Ninja – удаление файлового «мусора» с вашего жесткого диска  (неопр.). ferra.ru (22 сентября 2009).
• Clean System of Junk Files  (неопр.). Softpedia (16 декабря 2010). Архивировано 27 августа 2012 года.