# Noor IT-teadlane: erikoolis käinud kratt säästab radiolooge läbipõlemisest

- Link: https://kihulane.eu/arhiiv/22575
- Published: 2023-06-11T08:23:00+03:00
- Author: toomas

* Maailm seisab biomeditsiini ja tehnoloogia ristteel. See tähendab, et valmivad
   tööriistad, mis suudavad arstide toodetud tohutut pildimaterjali paremini kasutada.
 * Pilte töötlevad tehismõistused on juba väga head, kuid meditsiinikujutiste mõistmiseks
   tuleb neid eraldi treenida. Isegi siis ei asenda need inimest kunagi täielikult,
   sest masin loeb andmeid, aga ei mõista neid sisuliselt.
 * Praegu peab kopsuvähi sõeluuringus iga inimese kopsupilti vaatama kaks radioloogi.
   Ülekoormatud radioloogide tööd hõlbustaks edaspidi Fishmani juhitud tehisintellekti
   meeskonna poolt arendatud abistav mudel.
 * Kümmekonna aasta eest oli Eestis asjaajamine võrreldes Ukrainaga oluliselt vähem
   bürokraatlik. 

**Palju õnne noore IT-teadlase preemia puhul! Vabariigi President pidas teid väljateenitult
selle tunnustuse vääriliseks. Ometi tegutsete ju väga kiiresti arenevas valdkonnas.
Kuidas on teil õnnestunud suurandmemassis vee peal püsida ja muutustega kaasas käia?**

Aitäh. Eks see on korraga akadeemia võlu ja valu, et ühest küljest arendatakse välja
nii palju uusi asju, aga teisest küljest jäädakse tööstuses kinni kord välja valitud
tehnoloogiasse.

Akadeemilises maailmas juhendan igal aastal uut käputäit tudengeid. Uutele bakatudengitele
on vaja välja mõelda uued lõputööprojektid. Ühtlasi loen igal aastal uut kursust.
Teisisõnu annab ülikooli tööstiil ja kogu akadeemiline sfäär võimaluse uuendustega
kohaneda. Mina saan uusi asju näha ja proovida neid oma tudengite silmade ja käte
läbi. Ütlengi neile näiteks: “Vaata, selline uus huvitav asi tuli välja”.

“Minu valdkond on pildiandmed (_imaging_) ehk kõik see, mida võite näha digiekraanidel.”

Muide, ütlen siinkohal kohe ära, et ChatGPT-ga mina tööd ei tee; küll aga teiste
mudelitega. Minu valdkond on pildiandmed (_imaging_) ehk kõik see, mida võite näha
digiekraanidel. Täpsemalt spetsialiseerungi oma töös bioloogia ja meditsiiniga seotud
kujutistele. Juhin ka sellega tegelevat töörühma ja olen pildiandmetega tegeleva
firma kaasasutaja. Samuti tegelen nendega uurijana.

Näiteks töötan mudeliga, mis kannab nime SAM ehk _Segment Anything Model_ (‘kõige
segmenteerimise mudel’). _Segmenteerima_ tähendab ‘pildilt objekti tuvastama’. Näiteks
tegite minust ennist auditooriumis pilti. Mudel leiaks selt pildilt minu, kõik toolid,
tahvli jne. See ütleks, et “Siin on pildil inimene, siin tool ja siin arvuti.”.

Kui mõni uus tudeng juhendamist vajab, ütlengi talle, et “Näe, mind väga huvitab
see uus mudel – see on põnev ja ma tahan seda järele proovida. Tahan näha, kuidas
see minu andmetega ja kujutistega töötab”.

Suurte objektide kujutistega, näiteks inimeste- ja toolipiltidega on kindlasti lõbus
töötada. Mina aga töötan erinevat liiki vähirakkudega. Teinekord juhtub, et olemasolevad
pilditöötlusmudelid ei tööta kuigi hästi, kui neid hoobilt nii teises vallas rakendada.
Järelikult tahan näha ja ise hinnata, kui hästi need töötavad. Ma tahan, et tudeng
aitaks mul seda uut ägedat imeasja minu andmetel jooksutada. Nii see ajaga kaasaskäimine
toimib.

![](data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///ywAAAAAAQABAAACAUwAOw==)

Dmytro Fishman ja Airika Harrik. Autor/allikas: Sofia Lutter

**Kui suurt huvi te üldse üliõpilastes oma teema vastu näete? Ja arvestades, et 
tehismõistusega käib kaasas hulganisti kiidulaulu ja vahtu, siis kui palju tuleb
teil maandada tudengite ebarealistlikke ootusi?**

Tudengid on absoluutselt sellest huvitatud. Ootusi näen aga seinast seina. Mul on
tudengeid, kellel pole mingeid illusioone. Nemad ütlevad mulle, et ei taha kogu 
sellest tehisaru-kiidulaulust midagi kuulda. Samas on mul täiesti vastasleeri kuuluvaid
tudengeid, kes usuvad, et tehismõistus lahendab hoobilt kõik meie probleemid ära.
Leidub ka neid, kes jäävad kuhugi sinna vahele.

Minu eesmärk lektorina on anda neile kõigile realistlikud ootused. Öelda neile, 
mida saab või ei saa selliselt tehnoloogialt oodata. Esimesel semestril ma seda 
teengi. Hiljem töötan juba oma kursuse läbinud tudengitega, kelle ootused on enam-
vähem tasakaalukad. Mõnel neist on juba omi kogemusi, nii et selles mõttes on see
üsna mõistlik seltskond.

**Saabusite Eestisse 2011. aastal ja olete siin elanud nüüdseks 12 aastat. Mis teid
aastate eest Eestisse tõi ja mis viis otsuseni siia jääda?**

Ma ei saabunud Eestisse teab mis romantilisel põhjusel. Olin toona Ukraina tudeng
Kiievi Polütehnilises Instituudis, toonases Ukraina Riiklikus Tehnikaülikoolis. 
See on üks Ukraina suuremaid ülikoole, kus õpib sõltuvalt lugemismeetodist umbes
20 000–30 000 tudengit. Aga ma ei olnud seal antava haridusega rahul.

“Ma ei saabunud Eestisse teab mis romantilisel põhjusel.”

See oli aeg, mil Ukraina tudengid said aru, et võimalik on minna ka Euroopasse ja
saada oma haridus sealt. Vahel õnnestus isegi stipendiumi saada. Niisiis hakkasid
inimesed nagu mina õppima inglise keelt ja kandideerima välisülikoolidesse.

Mina kandideerisin Aachenisse, mis on üks paremaid Saksa tehnikaülikoole. Sain sinna
sisse, aga stipendiumi mulle ei pakutud. Niisiis ei saanud ma endale Aachenis elamist
lubada. Samas kandideerisin ka Tartusse, sest kohtasin ühel tudengitele mõeldud 
kõrgharidusmessil Tartu inimesi. Nad olid väga sõbralikud ja otsisid ilmselgelt 
just minusuguseid inimesi. Siis polnud enam küsimustki.

**Olite maha müüdud?**

Olin müüdud. Programmijuht ütles mulle, et “Küll me sulle stipendiumi leiame – lihtsalt
tule.” Asi oligi otsustatud.

Kui siia tulin, olin algul veidi skeptiline. Kartsin, et leian eest sama ja mitte
kuigi meeldiva süsteemi. Siia saabudes mõistsin aga esimesel päeval, et Ukraina 
ja Eesti on riikidena ja oma süsteemide poolest täiesti erinevad.

**Kui peaksite nimetama Eesti ja Ukraina vahel ühe suure erinevuse, siis mis see
teie jaoks oleks?**

Toon tavaliselt näite, mis võtab kogu olukorra kokku. Kui tahtsid endale tudengina
ühiselamus kohta saada, pidid toona Kiievis käima ja sadadele ustele koputama. Kogu
su paberimajandus pidi korras olema ja pidid muudkui oma isikut tõendama. Bürokraatiaparaat
oli tohutu.

Kui siia saabusin, olin sisimas valmis sama kadalippu läbi tegema. Läksin siis ühiselamute
administraatori akna juurde, näitasin oma passi ja ta andis mulle selle eest võtme.
Ma ei jõudnud seda ära imestada. Mõtlesin: “Mis see veel on? Järgmise ukse võti,
millele ma koputama pean?” Tema aga kinnitas, et see ongi minu toavõti – mida mul
siis veel vaja on? Olin jalust rabatud. Kuidas ta sai mulle lihtsalt võtme anda?
Viimati olid mul mingid õelad kavatsused?

“Kohalik bürokraatia peaks sind eemale peletamise asemel aitama ja Eestis see nii
oligi.”

Ehk jah, Eesti inimesed kurdavad bürokraatia üle, aga neil pole aimugi, kuidas ebameeldiv
bürokraatia päriselt välja näeb. Minu jaoks on see imeline. Kohalik bürokraatia 
peaks sind eemale peletamise asemel aitama ja Eestis see nii oligi.

Võib-olla nüüd on asjad teisiti. Ma ei oska praegust olukorda Ukrainas kommenteerida,
sest olen 12 aastat Eestis elanud. Mul on Ukrainas mõned sidemed ja kontaktid, aga
süsteemile ma hinnangut anda ei oska. Küll aga olen siin väga õnnelik ja siinse 
süsteemiga rahul.

**Eks ka Eesti kui riik ja ühiskond on 12 aastaga kahtlemata muutunud. Kuidas teie
seda muutust tajute?**

Puhtalt igapäevaelu vaatevinklist olen näinud ainult muutusi paremuse poole. Oleme
oma instituudiga kolinud Liivi 2 majast siia (Deltasse, toim) – see oli suur samm
edasi. Delta on oluliselt parem koht: siin on kõvasti rohkem ruumi, kogu hoonetaristu
on meeldivam ja teadlasena sa ei oskakski rohkemat tahta. Kõik vajalik on olemas.

Sissetulekute ja maksude vaatenurgast tundub mulle, et vähemalt mu enda valdkonnas
ehk IT-sektoris on mul seni olnud ainult meeldivad kogemused. Niisamuti on kogu 
toetusest, mida Eesti on Ukrainale sõja ajal pakkunud, olnud minusugustele inimestele
äärmiselt suurt abi.

Eestis polnud enne sõja algust just palju Ukraina päritolu inimesi, kes oleks teadusega
seotud. Ühtekokku oli meid varem umbes 340 ja enamik neist erinevate õppeastmete
tudengid. Nüüd on meid palju rohkem. Toona olin mina aga ilmselt ainus kraadiga 
õppejõud. Saime tohutu palju toetust, mis võimaldas meil päriselt tööd teha ja toimida,
samas kui olukord taustal eskaleerus ja inimesed surma said ehk meil on olnud äärmiselt
head võimalused.

**Auhinda vastu võttes peetud kõnes ütlesite, et oleme jõudnud kahe väga olulise
uurimissuuna ristteele. Omavahel kohtuvad nüüd biomeditsiin ja tehnoloogia. Mida
see kummagi valdkonna teadlastele tähendab? Mida inimestele, nagu te ise olete?**

Bioloogia- ja meditsiiniteadlaste andmete hankimiseks kasutatud tööriistad muutuvad
praegu üha paremaks ja paremaks. Järelikult tekib teadlastel rohkem andmeid. Bioloogid,
arstid ja kõikvõimalikke uuringuid tegevad inimesed on võimelised tootma neid hetkega
hiiglaslikes kogustes. Häda on aga selles, et teadlastel puuduvad tööriistad, mis
aitaks neil kogu selle tohutu andmekoguse läbi analüüsida.

“Teatud ülesannetes on meil nüüd inimesest paremad algoritmid.”

Teisalt oleme arvutiteaduses välja arendanud vägagi võimekaid tehnoloogiaid, nagu
ChatGPT – ehk siis hiiglaslikke loomuliku keele ja piltide töötlusmudeleid. Need
on paremad kui kunagi varem. Tahan öelda, et meie päralt on viimase sõna vidinad,
mis üldjuhul tulevad inimesest paremini toime. Teatud ülesannetes on meil nüüd inimesest
paremad algoritmid. Mõnedes asjades on neil muidugi veel arenguruumi.

![](data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///ywAAAAAAQABAAACAUwAOw==)

Dmytro Fishman. Autor/allikas: Sofia Lutter

**Mõtlengi, et kui kasvõi näiteks Bingilt küsida “Mis kell on?”, võib see ka päise
päeva ajal öelda, et “Kell on kolm öösel”, sest treeningandmetes tuli sel selline
näide ette. Masin ei saa veel sõnade tähendusest aru. Kuidas te saate seda näiteks
röntgenpiltide tõlgendamisel päriselt usaldada?**

Mina olen töötanud sellist tüüpi kujutistega, mida nimetatakse heleväljapiltideks.
Kui palja silmaga mõnd sellist pilti vaataksid, ei näeks sa midagi. Mina vähemalt
oma silmaga küll ei näe. Ometi suudab mudel erinevalt inimestest neilt kujutistelt
rakke tuvastada – kui need inimesed pole just oma ala eksperdid, kes on näinud taolisi
pilte loendamatuid kordi.

Siin tulebki mängu kahe valdkonna ristumine. Nimelt on sul tarvis kõvasti andmeid,
et sellist tehnoloogiat tööle panna ja andmed on sul ju juba olemas. Järelikult 
on praegu parim aeg, mil korraga on olemas nii andmed kui ka sobivad tööriistad.
Neid tarvitseb vaid parimate tulemuste saavutamiseks rakendada.

See ongi sisuliselt minu uurimistöö tuum. Ühest küljest üha kasvav andmemass ja 
teisest küljest uued lahedad uuringud tehisintellekti ja masinõppe vallas. Meie 
viime need lihtsalt kokku.

**Milline on see peidetud teadmine, mis meid kõigil neil biomeditsiini kujutistel
peidab? Kas me üldse teame, mida me veel ei tea?**

Neid asju on nii kujuteldamatult palju. Võime iseenda kohta midagi uut teada saada,
milleni üksnes inimmõistuse toel kunagi ei jõuaks, sest läbivaatust vajav andmemass
on niivõrd suur.

Näiteks tuleb sul läbi vaadata hulganisti vähiravi tuvastusuuringuid, mis põhinevad
suurel andmemassil. Pead töötlema suurt hulka rakke ja jälgima nende muutusi. Põhimõtteliselt
käib see nii, et arendad välja ravimi, manustad seda ühele rakukolooniale, aga teisele
lisad näiteks suhkrut. Siis paned mõlemad rakukolooniad Petri tassile kasvama. Seepeale
ütlebki süsteem sulle, kas on näha mingeid muutusi ja millised need muutused on.
Vastasel korral peaksid sa kõik pildid ise läbi vaatama, kõike mõõtma, ise statistikat
tegema ja nii edasi. Tänapäeval tarvitseb sul aga vaid klõpsata ja saadki kõik tehtud.

“Mudel teeb mõned asjad kohe ära ja sinu kui patoloogi asi on lihtsalt kinnitada,
et tulemus näib mõistlik.”

See on vaid asja üks külg. Teisest küljest on meil tohutu võimekus nii mõndagi käsitsi
tehtud ülesannet tõhusamaks teha ja ära automatiseerida. Tõin oma kõnes patoloogianäite.
Nimelt on näiteks Tallinnas olemas eraldi patoloogialabor, kus arstid teevad biopsiaid.
Nad eraldavad erinevatel eesmärkidel osakese inimese koest.

Oleme näiteks töötanud viljatuse ennustatavuse kallal. Vaatame selleks munandikoe
rakke. Kui nende seinad on liiga paksud, on see inimene sageli viljatu. Tavaliselt
käib see nii, et inimpatoloog peab need ülesvõtted ehk skannid läbi vaatama. Skannid
ise on tohutud: 10 000 korda 10 000 pikslit ja need kõik tuleb läbi vaadata. Rakud
tuleb ära mõõta ja hinnata seejärel rakuseinte paksust. Kõik saadud mõõdud tuleb
kvantifitseerida ja kuidagi ära analüüsida – alles siis saad sa mingisuguse tulemuse.

Nüüd võid lükata selle kõik lihtsalt mudeli õlule. Mudel teeb mõned asjad kohe ära
ja sinu kui patoloogi asi on lihtsalt kinnitada, et tulemus näib mõistlik. Ongi 
kõik. Niimoodi jõuad sa palju rohkem asju tehtud. Sa ei põle nii hullult läbi. Kui
peaksid kõiki neid samme oma käega tegema, nõuab see palju aega ja energiat. Patoloogid
on sellest muide väga huvitatud. Nad pöörduvadki meie poole ja paluvad, et selline
lahendus valmis saaks.

Nagu näha, on meil palju andmeid, mida me ei saaks muidu analüüsida. Sõltuvalt uuringutüübist
suudame sealt palju ägedaid asju kätte saada.

**Kõik need andmed seisaks muidu kasutuseta.**

Jah, sul on ühest küljest kuhjade viisi andmeid, mida keegi ei kasuta, sest sul 
lihtsalt puudub selleks võimekus. Teisest küljest on sul ametid, mis nõuavad palju
korduvaid ja inimeste jaoks tüütuid tegevusi. Nende tööde tegijad sooviks oma tööd
tõhusamaks muuta, et neil jääks rohkem aega loomingulisemateks ja põnevamateks tööülesanneteks.
Meie saame kummalgi juhul appi tulla.

**Nagu ütlesite, on teil ka oma töörühm, mis keskendubki erinevate biomeditsiiniliste
pildiandmete analüüsimisele tehisaru abil. Kas teie töörühm loobki meie arstidele
ja teadlastele kõik need kauaoodatud tööd hõlbustavad võimalused?**

Just. Me ehitame nii lahendusi, mis aitavad tööd optimeerida kui ka neid, millega
andmeid analüüsida. Lisaks teeme koostööd katsete tegijatega: aitame neil nende 
katsetulemusi analüüsida, loome neile selleks paremaid tööriistu, aga aitame ka 
mõningaid väga ränki tööülesandeid hõlbustada.

![](data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///ywAAAAAAQABAAACAUwAOw==)

Dmytro Fishman. Autor/allikas: Sofia Lutter

**Mainisite oma kõnes sedagi, et teete koostööd akadeemiliste asutuste, eraettevõtete
ja haiglatega, et seista silmitsi suure hulga biomeditsiini valdkonna katsumustega.
Mõni näide siin juba kõlas, kuid milliseid vorme on see koostöö veel võtnud?**

Me oleme ettevõtte alt teinud koostööd Tartu Ülikooli kliinikumiga, kus lõime käed
radioloogiaosakonnaga. See koostöö puudutab konkreetselt neeru-uuringuid. Ehitasime
neile süsteemi, mis vaataks kompuutertomograafia ülesvõtet enne radioloogi ennast.
Süsteem leiab ja tähistab seal ära kõik neerukasvajate märgid.

“Kaalul on kaugeltki liiga palju, et seda tööd lihtsalt ChatGPT-le teha anda.”

Lisame nende neerupiltide juurde teatud mõõtmistulemused. Praegu eeldab radioloogia
tööprotsess, et radioloog peab tegema seda käsitsi. Meie aitame radioloogil ette
valmistada ka lühiraporti, et teda suurest ajakulust ja vaevast säästa. Praegu käib
meil ühtlasi kliiniline uuring, kus kinnitame ja näitame, et meie lähenemisest on
päriselt abi.

Minu toodud patoloogianäites munandikoest oleme sama asja teinud. Õpetasime välja
mudeli, mis tuvastab rakke, mõõdab rakuseina paksust ja aitab tööprotsessis selle
tööjupi eeltööd teha.

**Ehk siis teie eesmärk on inimarste aidata, mitte lõpuks targa ja andeka SAM-i 
või muu mudeli vastu välja vahetada?**

Ei. Näeme selgelt, et need mudelid vajavad inimese pilku. Kaalul on kaugeltki liiga
palju, et seda tööd lihtsalt ChatGPT-le teha anda. Nagu isegi teate, räägib ChatGPT
mõnikord kõvasti ja valesti. See paneb ikka täiesti puusse, aga teeb seda ülima 
enesekindlusega.

**Mõtlengi, et me ei saa usaldada tehisaru jäägitult, eriti veel elu ja surma küsimustes.
Te ilmselt ei usaldaks end praegu SAM-i hoolde?**

Justnimelt. Sa ei tahagi sellises küsimuses SAM-i usaldada, sest vähemalt ma ise
tean, et see mudel ei tööta meditsiiniliste kujutistega alati hästi. Niisiis tuleb
arendada oma mudel valdkonnaspetsiifilisemaks. Sul võib olla väga üldine mudel, 
mis toimib hästi lampide ja laudade puhul, aga kui tahad seda rakendada kasvajate
ja hemorraagiate peal, siis see lihtsalt ei tööta. Tulemus ei tule nii hea.

**Kas teil on oma tausta arvestades ka Ukrainast koostööpartnereid või poleks see
praegust olukorda arvestades mõeldavgi?**

Siiamaani on mul olnud Tartu Ülikoolis väga palju Ukrainast tulnud üliõpilasi. Olen
ühtlasi poole kohaga külalislektor Ukraina Katoliiklikus Ülikoolis – sealtkaudu 
tuleb mulle samuti üliõpilasi. Seni mul peamiselt asjade praeguse seisu tõttu Ukraina
partneritega ühtki koostööprojekti olnud pole. Praegu ei ole teadus seal just suurim
prioriteet.

**Kujutan ette.**

See pole, jah, praegu võimalik. Oleme aga kindlasti avatud ja otsime igasuguseid
võimalusi. Ettevõttena peame läbirääkimisi Ukraina kohalike haiglatega. Näiteks 
Neurokliiniku ja Püha Paraskeva meditsiinikeskustega Lvivis. Võtame ka Ukrainast
mitmeid delegatsioone vastu.

**Nagu enne ise ütlesite, tegutsete oma valdkonnas mitme nurga alt. Oma Linkedini
profiilil hoiatate teiega vestelda soovivaid inimesi, et nad paneks end valmis teie
hooplemiseks oma idufirma Better Medicine kaasasutamise üle. Kiidelge siis ka nüüd
natuke: millega Better Medicine tegeleb?**

Ma olen Better Medicine’i üle väga-väga uhke. Sellel on viis kaasasutajat, mina 
nende seas. Kui ütlen firmast rääkides “mina”, pean silmas “meid viiekesi”.

Minu jaoks isiklikult oli see võimalus oma uuringud elama panna. Põhimõtteliselt
on see võimalus näha, kuidas teadus väljaspool elevandiluutorni töötab. Teadlastena
loome mõnikord asju, mis tingimata päris andmetega ei toimi. Mina tahan näha uuringuid,
mis midagi päriselt ära teevad ja oma mõjuga ühiskonda panustavad. Selleks saigi
loodud Better Medicine.

“Praegu käib meil kaks kliinilist katset, mis on idufirma kohta väga hea.”

Alustajate kohta oleme olnud väga edukad. Tegutsemisvaldkond on meil iseenesest 
karm. Kui räägid inimestega, kes teavad midagi investeerimisest, ütlevad nad sulle
tavaliselt, et ära meditsiini küll mine. Sa ei jää seal ellu!

Praegu, eriti sõja ajal, on investeerimiskliima väga külm. Mistahes erarahastust
on väga raske saada, eriti Venemaa lähiriikides. Alati jääb õhku küsimus, kas teie
siin olete järgmised. Kas teil on ka varsti tankid tänavatel? See kisub atraktiivsuse
alla.

Meid saatis samas avaliku rahastuse saamisel suur edu. Saime üle 800 000 euro EAS-
i toetust. Lisaks oleme tuge saanud erakapitalilt. Oleme esitanud taotluse Euroopa
Innovatsiooninõukogu kiirendi programmi ehk oleme olnud väga leidlikud, et asjadega
hakkama saada.

Praegu käib meil kaks kliinilist katset, mis on idufirma kohta väga hea. Meil on
neerumudel katsetamisjärgus ja tahame teisalt pakkuda ammendavat lahendust kopsuvähi
sõeluuringule.

Tartu Ülikooli kliinikumis töötab inimene, kes ongi ennekõike kopsukirurg. Ta otsustas
korraldada kopsuvähi sõeluuringu ja teha selle esmakatsetus siin Tartus. Esmauuringus
osalesid suure kopsuvähki haigestumise riskiga inimestel. Nad tulid ja lasid endale
teha kompuutertomograafia, mille tulemusel saame töötada nüüd tuhandete kopsuskannidega.

Radioloogia vaatevinklist on see karm töö, sest iga skanni peaks analüüsima kaks
radioloogi, aga radioloogidel on niigi palju tööd. Tartu Ülikooli kliinikumis on
kõik radioloogid väga ülekoormatud ja seetõttu on selliseid projekte nendega raske
teha.

“Tartu Ülikooli kliinikumis on kõik radioloogid väga ülekoormatud ja seetõttu on
selliseid projekte nendega raske teha.”

Kogu Eesti peale on selliseid suure riskiga patsiente aga 40 000 ringis. Nende kõigiga
on vaja ühendust võtta ja neid sõeluuringusse kutsuda. Seejärel tuleb neist igaühe
andmeid analüüsida kahel inimesel. Osa uuritavatest saadad sa veel järeluuringusse,
sest muidu sa ei näe, kas kasvaja on kasvanud, kahanenud või samaks jäänud. Kui 
kasvaja on suurenenud, annab see märku, et see tuleb operatsiooniga eemaldada. Eriti
kui see on pahaloomuline või on oht, et see muutub pahaloomuliseks. Tahamegi pakkuda
lahendust, mida sõeluuringu korraldamise protokollides kasutada. Aitame radioloogidel
aega kokku hoida.

Meie põhitöö käibki nende kahe projekti kallal. Ühtlasi on meil sidemed ettevõttega
AstraZeneca, mis on huvitatud kopsuvähi sõeluuringutest. Aitame neidki nende projektis.
Lisaks oleme koostööd alustamas ühe Põhja-Euroopa suurima era-onkoloogia keskusega.
Neidki huvitab meie teenus. Selles mõttes oleme üsna edukad.

Minu nimel on muide ka patent tehnoloogiale General Medical Purpose AI ehk üldmeditsiiniline
tehisintellekt.

**Mida see endast kujutab?**

Kogu idee tekkis mul oma varasemate uuringute põhjal. Nägime selles idees potentsiaali
ja patenteerisme selle ära. Nüüd arendame juba vajalikku tehnoloogiat.

Loodav uus tehnoloogia on oluline, sest Eestis on meil selline asi nagu Pildipank–
sisuliselt on see suur meditsiiniandmete arhiiv. See toimib alates 2009. aastast
ehk umbes 15 aastaga on sinna kogunenud pea 1,6 petabaiti meditsiinilisi pildiandmeid.
Oleme loonud lähenemise, mis aitab meil selliseid suuri andmehulki kasutada. Samuti
saame ehitada süsteemi teisiti, kui praegusi mudeleid ehitatakse.

“Meie oleme nüüd patenteerinud lähenemise, mis võtab suure pildiandmestiku, kus 
ei ole radioloogide piirjoonemärkmeid.”

Praegu käib see nii, et palkad rühma radiolooge, kes võtavad pastaka ja joonistavad
ülesvõtte peale kasvaja asukoha piirjooned. Sina näitad neid pilte mudelile ja ütled:“
Vaata, mudel, see on kasvaja. Palun ütle mulle, kus teisel skannil kasvaja on”. 
Mudel vastab sulle siis, et tal pole aimugi. Sina ütled siis, et see pole hea vastus.
Sa näitad mudelile teist kasvajapilti ja ütled: “See on kasvaja. Õpi see selgeks.”
Kui järgmisel korral küsid, vastab mudel sulle, et võib-olla tuleb kasvaja talle
isegi tuttav ette. Sa teed seda tuhandeid kordi väga paljude ülesvõtetega.

Selline on klassikaline kadalipp. Sul kulub mudeli väljaõpetamiseks kuid ja tuhandeid
eurosid, sest päris radioloogid ootavad töötasu. Nad on väga hõivatud ega tee selliseid
asju tavaliselt just meeleldi. Niisiis pead sa olema väga veenev ja maksma neile
piisavalt.

![](data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///ywAAAAAAQABAAACAUwAOw==)

Dmytro Fishman. Autor/allikas: Sofia Lutter

Meie oleme nüüd patenteerinud lähenemise, mis võtab suure pildiandmestiku, kus ei
ole radioloogide piirjoonemärkmeid. Samas on radioloogid iga pildi kohta teinud 
eraldi raporti TEHIK-usse ehk Tervise ja heaolu infosüsteemide keskusesse, haiguslugude
registrisse. Sinu asi on need andmed kokku viia.

“Tulemuseks saad ikkagi mudeli, mis suudab suhteliselt hästi leida patoloogiaid 
ja aitab diagnoosida laia spektrit haigusi.”

Sa ei näita enam mudelile piirjooni, vaid neid raporteid, ja ütled: “Vaata, mudel,
see skann on seotud selle raportiga. Mõtle nüüd välja, milline osa skannist põhjustas
selle, et raport on just selline.” Siis näitad mudelile miljoneid erinevaid skanne.
Pead olema kannatlik, sest see võtab aega. Samas aitab GMP meil sellist protsessi
oluliselt kiirendada. Lõpuks õpib mudel ära, millised fenotüübid – nimetame nii 
põhimõtteliselt seda, kuidas inimene sisimas välja näeb – panevad inimesi just selliseid
raporteid kirjutama.

Sel juhul ei pea sa palkama tervet armeed väga ületöötanud radiolooge. Kõigi nende
andmete märgendamine ei lähe sulle ka nii kalliks maksma. Tulemuseks saad ikkagi
mudeli, mis suudab suhteliselt hästi leida patoloogiaid ja aitab diagnoosida laia
spektrit haigusi. GMP-lähenemine on meil patenteeritud ja otsime sellele põhimõtteliselt
avalikku grandirahastust.

**Teisisõnu ei pidanud te enam oma rahastajatele, koostööpartneritele ja teistele
olulistele kõrvalseisjatele tõestama, et Better Medicine’i on vaja, vaid nemad vajasid
Better Medicine’i.**

Kui nii võtta, tarvitseb sul vaid heita pilk praegu kasutatavatele tööriistadele
ja mõistad, et uuenduste läbisurumine radioloogiavaldkonnas võtab aega. Kõiki osapooli
on vaja esmalt veenda, et innovatsioon on vajalik. Jah, neid tuleb kõvasti veenda,
aga õnneks on meil meeskonnas väga hea veenja. Omal alal on tegelikult kõik meie
meeskonnaliikmed head. Ehk seni on meil läinud suurepäraselt.

**Oleme rääkinud pikalt-laialt teie tööst. Kui aga ühe noore lektori ja iduettevõtja
tööpäev tehtud saab, siis mida ta teeb?**

Püüan lõõgastuda sporti tehes: jooksen, sõidan jalgrattaga ja ujun. Teen põhimõtteliselt
klassikalist triatloni.

Praegu on Eestis ka minu perekond – nad on põgenikud. Oleme pärit Hersonist ja mu
perekond põgenes sealt enne linna vabastamist. Nad tulid Tartusse ja nädal pärast
seda Herson vabastati. Sellest hoolimata pole elu Hersonis praegu meelakkumine. 
See on väga karm – neid pommitatakse iga päev ehk koju naasta on ikkagi keeruline.
Veedan praegu nendega palju aega koos.

Mis veel? Õpin praegu eesti keelt. Samuti meeldib mulle väga raamatuid lugeda. Kui
siin inimestelt küsida, et mis minu juures kõige tüütum on, ütlevad nad ilmselt,
et tavaliselt panen neid raamatuid lugema. Mul on laual terve raamatukuhi ja kui
keegi mu kabinetti juhtub,  soovitan ma tavaliselt talle kohe midagi: näiteks mõnd
imelist raamatut immunoloogiast, kognitiivsest teadusest või tehisaru ajaloost. 
Kognitiivne teadus on samuti üks mu meelisteema: miks me valetame, millegi üle õnnelikud
oleme, miski meid vihastab,  teineteisega just sellisel moel räägime ja nii edasi.

**Mida te viimati lugesite?**

Praegu loen Timothy Snyderi raamatut, “Türanniast” (_On Tyranny_). See on praeguse
olukorraga vägagi kooskõlas. Seal kirjeldatakse paljusid USA-s juhtunud asju, näiteks
Trumpi presidentuuri. Raamatust on olemas ka laiendatud versioon, mis käsitleb Putinit,
Ukrainat ja kõike sellega seonduvat.

“Ilukirjandust ma ei loe, aga teaduskirjandust küll. Olen niisiis teadusest vaimustunud
teadlane.”

Viimati lugesin ajaloo kohta, aga enne seda immunoloogiast. Tegin oma doktoritöö
arvutuslikust immunoloogiast. Analüüsisin seal antikehi ja nende külgetõmmet keha
enda rakkude poole – nii-öelda autoantikehi. See on olukord, kus immuunsüsteem pöördub
iseenda vastu. Näiteks juhtub see diabeedi või multiskleroosi puhul. Raamat meeldib
mulle samuti väga. Viis, kuidas seal imelist, aga äärmiselt keerulist immuunsüsteemi
kirjeldatakse, on lihtsalt hämmastav. Doktorikraadi võisin ju omandada küll, aga
see raamat õpetas mulle ikkagi palju.

Ilukirjandust ma ei loe, aga teaduskirjandust küll. Olen niisiis teadusest vaimustunud
teadlane. Ma ei ole see inimene, et kui lähed talle juurde ja ütled: “Kuule, mida
sa arvad ontoloogiast _versus_ sekventsialismist moraalifilosoofias?”, siis ta vaatab
sind tavaliselt arusaamatu näoga.

**Teie hoopis rõõmustaksite, kui keegi teile sellise küsimusega läheneks?**

Täpselt. Oleksin väga-väga põnevil.

![](data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///ywAAAAAAQABAAACAUwAOw==)

Dmytro Fishman. Autor/allikas: Sofia Lutter

[Loe otse allikast](https://novaator.err.ee/1609002467/noor-it-teadlane-erikoolis-kainud-kratt-saastab-radiolooge-labipolemisest)
